Das Naturschutzgebiet und seine unmittelbare Umgebung sind mit Lippischer und Preußischer Velmerstot die höchsten Erhebungen des Eggegebirges. Der in Nord-Südrichtung verlaufende Gebirgszug bildet mit seinen hohen Niederschlagssummen (1200 mm pro Jahr) und rauen Temperaturen eine Klimascheide. Dementsprechend treten hier bereits für höhere Mittelgebirge typische Tier- und Pflanzenarten auf. Dieser Übergangscharakter trägt zu der besonderen Artenvielfalt des Schutzgebietes bei. Stellvertretend für viele andere Arten weisen in den Kammlagen der Große Schillerfalter und die Kurzflügelige Beißschrecke auf die besonderen kühl-feuchten Bedingungen hin.

Die von Blaubeere und Besenheide dominierte Bergheide auf der Velmerstot ist eines der wenigen erhaltenen Beispiele für diesen ehemals die Kammlagen prägenden, durch Beweidung entstandenen Kulturlandschafts-Lebensraum. Der besondere landschaftsästhetische Reiz ergibt sich, abgesehen von den weiten Blickbeziehungen in das Umland, auch aus der Einbettung der Hochheide in eine urwüchsig erscheinende, abgeschiedene Landschaft. Hierzu tragen von Mischwäldern bestandenen Blockschutthalden am Osthang und mehrere aufgelassene, historische Steinbrüche wesentlich bei. Die Ausdehnung der Silikatfelsstrukturen war einer der entscheidenden Schutzgründe. Neben einer artenreichen Moosflora haben sie eine besondere Bedeutung als Brutplätze und für überwinternde und schwärmende Fledermäuse.

Auf den Sandsteinböden des Naturschutzgebietes dominieren artenarme Hainsimsen-Buchenwälder mit einem zur Kuppe hin steigenden Nadelholzanteil. Charakteristische Arten der Krautschicht sind Siebenstern, Draht-Schmiele und Faulbaum. Über dem fetten Juratone an den Unterhängen wachsen artenreichere Waldmeister-Buchenwälder, in denen im Umfeld des Silberbaches noch ein erhöhter Anteil von Eichen vorhanden ist.

Auffällig ist der Wasserreichtum des Gebietes. Zahlreiche, stetig schüttende Quellhorizonte bilden zum Teil tief eingeschnittene Kerbtäler mit sauberen Quellbächen. Zusammen mit den angrenzenden Waldgebieten ist das Naturschutzgebiet Lebensraum zahlreicher gefährdeter Tierarten. Neben Uhu und Schwarzspecht sind hier unter anderem die regelmäßig im Bereich der Egge nachgewiesene Wildkatze, das Haselhuhn und eine größere Siebenschläfer-Population zu erwähnen. Die besondere Bedeutung des Gebietes und des Gebirgszuges allgemein ergibt sich auch aus seiner Funktion als Leitsystem für waldgebundene Arten im Rahmen des überregionalen Biotopverbundes. Das Gebiet wird durch Eggeweg und Hermannsweg erschlossen.